Na Custódia São Benedito da Amazônia, o ingresso dos candidatos à formação inicial é antecedido pelo acompanhamento vocacional, onde durante um ano ou quanto tempo for necessário, o candidato participa dos encontros vocacionais, aprofundando e discernindo a sua vocação. Este acompanhamento acontece nas diversas fraternidades que compõe a Custódia, coordenado pelo animador vocacional da fraternidade local, com a colaboração dos demais membros da fraternidade.
O acompanhamento vocacional também poderá ser realizado através dos meios de comunicação e das mídias digitais, caso o candidato à vida franciscana resida em uma cidade onde os Frades Menores não estejam presentes.
Terminado o período de animação vocacional, o candidato é recebido na Fraternidade de Acolhida Vocacional (FAV). Durante seis meses participa da vida fraterna, inserido em uma fraternidade da Custódia, onde passa a experimentar mais de perto o carisma franciscano. É tempo de conhecimento mútuo. A formação se dá a partir das orientações da Ordem para este tempo de aprofundamento e discernimento vocacional.